alignments/CPlasFal_172.align.Z


1.  Plasmodium falciparum NF54 (D.A.Fidock)
2. cbsPfHB3.1, Debopam Chakrabarti
3. czapPFDd2.1, Debopam Chakrabarti
4. gmbPfHB3.1, G. Roman Reddy
Library numbers are appended to the dbEST_ID with _# +/- indicates the orientation of each clone.

******************* Contig 172 ******************** . : . : . : . : . : . : 1199892_4- ATTCATTTCTACTTTGGTTCCATCTTTTTCATATGTTCTTGATTTAGATGAATCATATAG 60 ____________________________________________________________ consensus ATTCATTTCTACTTTGGTTCCATCTTTTTCATATGTTCTTGATTTAGATGAATCATATAG 60 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- ATGTTTAGTTAAACATCCTGCAGTTGTACATTTAACACTTGGGACCCATAAATTAGCAGA 120 ____________________________________________________________ consensus ATGTTTAGTTAAACATCCTGCAGTTGTACATTTAACACTTGGGACCCATAAATTAGCAGA 120 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TCCTGTATCAAGAATAAATGTAAATGGTTGTTGGTTATCTCCAACTTCTGCATCACCATA 180 ____________________________________________________________ consensus TCCTGTATCAAGAATAAATGTAAATGGTTGTTGGTTATCTCCAACTTCTGCATCACCATA 180 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- AAACATTATATTTTGGAAATCTACTAATTCGATATTATCATTTGAACTACCTAAATAATT 240 ____________________________________________________________ consensus AAACATTATATTTTGGAAATCTACTAATTCGATATTATCATTTGAACTACCTAAATAATT 240 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TGTTTTAGTAAGTCCTGAATTAAGAAAATTGACAGATTCTTTAATGTAATTTTTTAATTT 300 ____________________________________________________________ consensus TGTTTTAGTAAGTCCTGAATTAAGAAAATTGACAGATTCTTTAATGTAATTTTTTAATTT 300 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- ATGTGTTTTTATAGTTTTCAAAATTCTATCATGTGCATTTTCAACTTTAAATCCAATAGT 360 2909_4- NGNTTTTANAGTTTNCAAAANCCTACCATGTGCATTTCCAACTTTAAANCCAATAGT 57 ____________________________________________________________ consensus ATGTGTTTTTATAGTTTTCAAAATCCTACCATGTGCATTTCCAACTTTAAATCCAATAGT 360 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TAAATGTTCGGAATTTTTTAAAATTTCATTCATTTCATTATCTCTTTGAAGCCATACATT 420 2909_4- TAAATGTTCGGAATTTTTTAAAATTTCATTCATTTCATTATCTCTTTGAAGCCATACATT 117 ____________________________________________________________ consensus TAAATGTTCGGAATTTTTTAAAATTTCATTCATTTCATTATCTCTTTGAAGCCATACATT 420 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TTCATACACATAATAAAATAAACCACACATTACACTACAAAAGAGAAGTACATATAGTAT 480 2909_4- TTCATACACATAATAAAATAAACCACACATTACACTACAAAAGAGAAGTACATATAGTAT 177 ____________________________________________________________ consensus TTCATACACATAATAAAATAAACCACACATTACACTACAAAAGAGAAGTACATATAGTAT 480 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TTGAAATCCTTTCTGTATTTTTTTTTTGTTCTTTGAATTGTCAATGTTTAATCCATCAAA 540 2909_4- TTGAAACCCTTCCTGTATTTTTTTTTTGNNCTTTGAATTGTCAATGTTTAANCCATCAAA 237 ____________________________________________________________ consensus TTGAAACCCTTCCTGTATTTTTTTTTTGTTCTTTGAATTGTCAATGTTTAATCCATCAAA 540 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TGTTGAATTGCTTTTGATAAAGCCATGTTTAAAATCATGTTCTCTTACTGTAATATCCAT 600 2909_4- TGTTGAATTGCTTTTGATAAAGCCATGTTTAAAATCATGTTCTCTTACTGTAATATCCAT 297 ____________________________________________________________ consensus TGTTGAATTGCTTTTGATAAAGCCATGTTTAAAATCATGTTCTCTTACTGTAATATCCAT 600 . : . : . : . : . : . : 1199892_4- TTGGTTCAAAATATTTATTAAAAA---AAAAAAAAAT-ATATATATAA 656 2909_4- TTGGTTCA 357 504466_3+ ATTTAAAATTTAAAAAAAAATTATATATATAAAAATAAATAAAC 44 ____________________________________________________________ consensus TTGGTTCAAAATATTTATTAAAAATTTAAAAAAAAATTATATATATAAAAATAAATAAAC 660 . : . : . : . : . : . : 504466_3+ TTTTTATATTAATTTATAAAAAAATTATATTTCTTTTTTATATTTTATATTAAAATTTAC 104 ____________________________________________________________ consensus TTTTTATATTAATTTATAAAAAAATTATATTTCTTTTTTATATTTTATATTAAAATTTAC 720 . : . : . : . : . : . : 504466_3+ ATACCAAATTCTTCTTTTCCATTCTACATATTTCCGTTAAATACTTTTTATACTGAAAAT 164 ____________________________________________________________ consensus ATACCAAATTCTTCTTTTCCATTCTACATATTTCCGTTAAATACTTTTTATACTGAAAAT 780 . : . : . : . : . : . : 504466_3+ TTTATATTTAT 175 ____________________________________________________________ consensus TTTATATTTAT 791

Date: 16:34:14 on Sun 17 Dec 117.